プロテオーム分析実験の原理、ノウハウ、データ解析

再開催を依頼する / 関連するセミナー・出版物を探す
オンライン 開催

本セミナーでは、質量測定を基盤としたプロテオーム分析実験の原理やノウハウについて、データ解析の実例も織り交ぜながら、分析の一連の流れを把握していただけるように解説いたします。

日時

中止

プログラム

プロテオミクス (Proteomics) は、発現タンパク質群の動態 (プロテオームProteome) を包括的に分析することによって生命現象の全体像をつかむ学問です。分析技術の発展とともに、現在のプロテオミクスは基礎研究ばかりでなく医療の分野にも貢献しています。  本講演では、プロテオミクスのことを一通り理解したい方々を対象に、質量測定を基盤としたプロテオーム分析実験の原理やノウハウを解説します。データ解析の実例も織り交ぜながら、分析の一連の流れを把握していただけるような構成にします。

  1. プロテオミクスを始めよう!
  2. 質量測定を基盤とした分析
    1. 質量分析の威力
    2. 「ペプチド断片を測る」
    3. 試料調製における注意点
    4. 標識法と非標識法
    5. 翻訳後修飾の分析: リン酸化とNグリコシル化を中心に
  3. 質量分析と液体クロマトグラフィー
    1. 質量分析部のいろいろ
      • イオントラップ
      • 三連四重極
      • qTOF 他
    2. 測定データの取得方法
      • DDA
      • DIA
      • 選択イオンモニタリング
    3. 測定データ取得の高速化と高深度化
      • プロテオームの「ビッグデータ」
    4. 逆相液体クロマトグラフィーによるペプチド断片の分離展開
  4. LC-MS/MS測定データの処理と解析
    1. 一般的な処理手順: 同定情報と計量情報の統合
    2. アミノ酸配列データベース検索の原理
      • 偽陽性ヒットの検証
        • Target-Decoy検索とFalse discovery rate (FDR)
      • 複数のタンパク質におけるペプチド同定情報の共有
    3. タンパク質組成の試料間計量比較
      • 計量値の正規化
      • 比較計量値の散布図: MAプロットとボルケーノプロット
  5. おもな情報解析の手法
    1. Gene ontology (GO) の活用: 尤度解析
    2. 主成分分析 (PCA)
    3. クラスター解析 (階層クラスタリング)
    4. ウェブ上の情報解析ツール
  6. 分析実験と情報解析の実例
  7. プロテオームの分析計画から論文投稿まで
    1. 計画策定に当たっての注意点
    2. 公共リポジトリへのプロテオームデータの登録

受講料

複数名同時受講割引について

アカデミック割引

日本国内に所在しており、以下に該当する方は、アカデミック割引が適用いただけます。

アーカイブ配信セミナー