第1部 Pythonを用いたRDKitの使用と実演
(2022年9月13日 10:30〜13:00)
ケモインフォマティクスとは、化学分野における膨大な問題に対してコンピュータと情報科学的手法を利用することによりその解決を目指す学問分野です。本分野では化合物の情報を用いることが多いため、創薬研究や材料開発、毒性予測等の応用も活発に行われています。
本講演では、プログラミング言語PythonとPythonのケモインフォマティクス用ライブラリーRDKitを使いながら、ケモインフォマティクスの入門的な内容とその操作法を中心に紹介いたします。
- RDKitのインストール
- 化合物データベースと化学構造の表記
- ChEMBLデータベース
- PubChem データベース
- MOL形式、SDF形式
- SMILES記法、SMARTS記法
- RDKitでの分子フィンガープリントの生成
- RDKitでの分子記述子計算
- Mordredでの分子記述子計算
- データ解析・機械学習の基本理論
- データの前処理・データの可視化・回帰分析・クラス分類
- データの前処理
- データの可視化
- 回帰分析の実例
- クラス分類の実例
第2部 分式記述子計算を用いた毒性予測
(2022年9月13日 14:00〜16:30)
毒性はあらゆる医薬品・化学品の製品化を規定する重要な生理活性である。しかし、多くの場合そのメカニズムは複雑であり未知であることも多いため、対象タンパク質に基づく毒性予測は困難である場合が多い。そこで、多数の化合物情報から毒性の発現パターンを予測する応用的なQSAR解析法の開発が進んでいる。
本講演では、毒性予測手法を理解していただくことを目的として、QSAR解析で使用する方法と研究成果を紹介したい。
- 分式記述子を用いた毒性予測の考え方
- 様々な分子記述子
- 記述子掲載データベース
- 専用ソフトウェア・Pythonのアプリケーション
- Webサービス
- 様々な解析法
- 重回帰分析・PLS回帰分析・ロジスティック回帰分析
- 決定木・アンサンブル学習
- 人工ニューラルネットワーク・ディープラーニング
- 毒性解析事例
- 有害性発現経路 (AOP)
- ヒトにおける肝毒性・肺毒性
- 化審法におけるラット反復投与毒性
- 分子記述子を超えて
- 生化学的特徴量
- 分子画像認識 (DeepSnap)
複数名同時受講割引について
- 2名様以上でお申込みの場合、1名あたり 45,000円(税別) / 49,500円(税込) で受講いただけます。
- 1名様でお申し込みの場合 : 1名で 50,000円(税別) / 55,000円(税込)
- 2名様でお申し込みの場合 : 2名で 90,000円(税別) / 99,000円(税込)
- 3名様でお申し込みの場合 : 3名で 135,000円(税別) / 148,500円(税込)
- 同一法人内による複数名同時申込みのみ適用いたします。
- 受講券、請求書は、代表者にご郵送いたします。
- 他の割引は併用できません。
アカデミック割引
- 1名様あたり 30,000円(税別) / 33,000円(税込)
日本国内に所在しており、以下に該当する方は、アカデミック割引が適用いただけます。
- 学校教育法にて規定された国、地方公共団体、および学校法人格を有する大学、大学院、短期大学、附属病院、高等専門学校および各種学校の教員、生徒
- 病院などの医療機関・医療関連機関に勤務する医療従事者
- 文部科学省、経済産業省が設置した独立行政法人に勤務する研究者。理化学研究所、産業技術総合研究所など
- 公設試験研究機関。地方公共団体に置かれる試験所、研究センター、技術センターなどの機関で、試験研究および企業支援に関する業務に従事する方
- 支払名義が企業の場合は対象外とさせていただきます。
- 企業に属し、大学、公的機関に派遣または出向されている方は対象外とさせていただきます。
ライブ配信セミナーについて
- 本セミナーは「Zoom」を使ったライブ配信セミナーとなります。
- お申し込み前に、 視聴環境 と テストミーティングへの参加手順 をご確認いただき、 テストミーティング にて動作確認をお願いいたします。
- 開催日前に、接続先URL、ミーティングID、パスワードを別途ご連絡いたします。
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